但救世主是矩阵中的bug，是异数，是能够超越矩阵规则的存在，所以只有救世主能在矩阵中不惧甚至战胜黑衣人。
而这就是人类的筹码，因为几乎所有觉醒了的新人类都慢慢意识到了机器人复活人类绝不是一时兴起，矩阵也绝不是机器人建造的一个游戏而已，对于机器人而言，矩阵拥有着特殊的意义和价值。
虽然船长不知道矩阵的目的是什么，但他与很多人都确信矩阵对机器人很重要，而一个能在矩阵中发挥出超越规则限制力量的异数便能给原本毫无反抗之力的新人类带来一个重量级筹码，有可能让机器人退让的筹码，能给觉醒的新人类带来希望的筹码。
“……圣人并非人类，而是矩阵中的一个程序，也同样是我们的引路人，对人类带有善意，矩阵中第一个觉醒的人就是在圣人的引导下脱离矩阵的，如果说主神是矩阵系统的阳，那么圣人就是矩阵中的阴，它们两个便是矩阵中最特殊的存在……
我相信圣人说的话，也相信命运的安排，相信我，它能帮你找到自己的路……”
虽然经过训练，简博确实展现出了天赋，但并没有展现出超越船长的救世主的力量，可船长仍旧对简博的救世主身份深信不疑，并再次冒险降临矩阵，带简博来见对人类友好甚至抱以支持的圣人。
白令侠全神贯注的接受着影片时刻溢出的信息量，他能理解，作为三部曲的首部作品，必然要大量的铺陈设定，而这些让人目不暇接的设定也让本来就很宏伟的世界观变得更加深邃，而且还抹上了一层沉重的底色。
人类太弱小了，根本看不到反抗的希望，即便是救世主，也不过是增加人类的筹码逼迫机器人让步，允许人类来到地上建立家园而已，以月球作为主基地的机器人仿佛矩阵中的主神一般，从始至终都高高在上，难以触摸，更加难以反抗。
但如此沉重深邃的基调却有着极其爽快与商业化的表象——觉醒者在矩阵系统中的超人力量，与黑衣人的对抗，在机器的压迫下东躲XZ的可怜虫，到了矩阵中却仿佛超级英雄，而且是与秩序对抗的超级英雄。
这让整个故事在沉重到令人绝望的核心设定外包裹了一层超级英雄类型电影的外壳，再加上层出不穷的科幻设定，让人欲罢不能。
白令侠身为影评人直觉般的点评分析直到圣人出场后才被影院内的惊呼声打破，注意力重新回到了大银幕上。
一个留着两个小辫子的小女孩面容沉静，眼带笑意，边吃着糖果，边与同样诧异的男主角交流着。
在船长口中高深莫测的能预知未来甚至引导人类前进的圣人竟然是一个小女孩，而船长却并不惊讶。
原来圣人本就是一个独特的底层代码，能够千变万化，每一次与人相见都用不同的身体和相貌示人，这是圣人的本质所决定的。
圣人告诉简博他不是救世主，在他微有些失望但又隐隐松了口气后，对方又说出了它在简博身上看到的未来。
“你的船长认准了你就是救世主，任何人，包括你和我，谁也劝不了他，他为了这盲目的信念，愿意牺牲自己，救你一命，你将不得不做出选择，是他，还是你自己，你们其中一个会死，是谁，就看你的选择了。”
对于小女孩的“预言”，简博在郁闷中将信将疑，毕竟圣人在船长口中确实是神通广大的。
而很快，圣人的预言似乎开始应验。
飞船上早已有船员被黑衣人所引诱，或者说面对矩阵中流光溢彩的世界，现实中飞船上的生活乃至于华胥国中的生活确实是贫瘠而苦难的。
苦难的真实和美好的虚假对很多人来说确实是艰难的选择，何况人的感知不就是由五感而来吗？对一些人而言在矩阵中真实与虚假也许并不重要。
就这样，因为叛徒的出卖，黑衣人锁定了他们撤退的地点，一行人死伤惨重，船长为了掩护简博，对上了追击的黑衣人，在姜羡的带领下最终只有男女主两人找到了下一个藏有信息传输机的地点，意识顺利撤出了矩阵。
这场突如其来的变故后，飞船上除了驾驶员——觉醒的新人类并不信任人工智能，驾驶都由人工来操作——就剩下简博和姜羡二人。
其他随同一起进入矩阵的船员都已失去了呼吸，随着矩阵中的意识死亡，处在现实中的身体也随之死亡。
除了船长。
姜羡判断船长应该是被清道夫活捉，拷问涉及华胥国的情报，船长早已被黑衣人列为追踪目标，就是因为船长作为现实中觉醒新人类聚居地——华胥国的高层，知道华胥国的重要信息。