李渊基本上采纳了李世民的建议，只是对于李世民推荐李靖驻守潼关一事没有采纳，而是改派屈突通前往驻守潼关，只是命李靖从旁协助。
李世民从父亲的神情中隐隐地感觉到他对李靖的不信任。
“看来父皇对李靖前番的事情还耿耿于怀，对李靖还有提防戒备的心理。像李靖这样的人，只要是投奔了我们，又怎会有贰心呢！”
“父……”
李世民还想对父皇解释一下，可话到嘴边又缩回去了。
“既然父皇对李靖还有成见，估计现在跟父皇解释也没什么用。或许过一段时间，父皇就会自然而然地改变对李靖的看法吧！”
李世民虽然觉得派屈突通去镇守潼关也没问题，况且还有李靖辅助。只是自己来时曾力荐李靖，总觉得有点对不起他，不知他会不会在心里面有芥蒂。
“诶，怎么会呢！李兄的为人我还不知道吗，相信他暂时肯定也能理解父皇现在的决定的！”
李世民见父皇没有认可李靖，本想力荐。但现在大敌当前，也不好与父皇争执。他只好转而把屈突通拉到一边，叮嘱他遇事一定要多与李靖商量，多听一听李靖的意见。
“殿下放心！”
屈突通见李世民又专门交待自己，忙拱手答道：“末将知道殿下此次与薛举这一战的重要性，更知道潼关的重要性。殿下只管放心前去杀贼，末将一定会和李将军通力合作，确保潼关万无一失，为殿下解除后顾之忧！”
“嗯，如此甚好！那我就将潼关就拜托你们二位将军了！”
李世民听到屈突通的回答甚是欣慰，又向他详细地交待了潼关防务后，这才放心地让屈突通前往潼关。
李渊立即派都水监宇文歆出使东突厥。宇文歆以三寸不烂之舌，对莫贺咄设晓以利害并多致金帛，莫贺咄设见钱眼开，立即答应不再出兵助薛举。
解决了突厥的问题后，李渊便任命李世民为帅，率刘文静、殷开山、柴绍、丘行恭等八总管共四万余人出长安往西渡过黄河，与薛举大军对峙于高墌城（今陕西长武北）。
可天有不测风云，人有旦夕祸福。
事有凑巧，大军刚出发不久，李世民即罹患疟疾，浑身寒战、发烧，病重而不能视事。他勉强拖着病体领兵渡过黄河，到达高墌城布置完防务后即彻底病倒了。
但战事才刚刚开始，李世民只得强撑着病体召集大家于帐中开会。他诚恳地大家说道：“父皇命本王领兵剿灭薛举，我朝巩固关中、陇西的关键一仗即在于此。因此请大家务必要高度重视，确保万无一失。薛举残暴，朝野离心。劳师远征，粮草定然不济，况且三家同盟已折其一，剩下他与梁师都的同盟也是貌合神离，并不稳固。所以他现在肯定是想利用同盟尚在的机会，急于与我军速战、决战。我军只要坚守，以逸待劳，采取坚壁清野的战略，等他产生内乱时再行出击，这样就可以一举击败薛举了。从今日起，我军必须深沟壁垒，加强防备，坚守不出。有擅言……擅言战者斩！众人听明……明白了吗？”
李世民感觉浑身无力，身上或冷或热非常难受，说着话都不住地打颤。
“听明白了！我等坚守不出，有擅言战者斩！”
众将士齐声答道。
刘文静看出李世民病体沉重，没有气力，只是强打起精神说话，便上前安慰李世民道：
“殿下，您尽管放心。我们一定按照您的吩咐，坚守不出，以逸待劳，只等他生内乱就是了！”
李世民听到刘文静的话，放心地点了点头。
只是刚才说了那一段话，李世民就感觉身体疲累，头晕目眩，恶心想吐。他停了一会，平复一下眩晕而导致的恶心，然后又继续说道：“偏偏凑巧，本……本王在这个关键的时候又生病了。在本王养病这段时期，军中事务暂由长史刘文静、司马殷开山署理。”